Caracterização do perfil transcriptomico de Saccharomyces cerevisiae em resposta a compostos inibidores lignocellulósicos e identificação de genes candidatos a transporte e processamento de oligossacarídeos para produção de bioetanol

MsC. Felipe Eduardo Ciamponi

Doutorado

CNPq

Início: 03/2019

 

A produção de etanol a partir de fontes lignocellulósicas se apresenta como um problema cada mais complexo no panorama global de biocombustíveis. Dentre os principais problemas encontrados nos processos industriais, a presença de inibidores quimicos, como furanos e acidos organicos, prejudicam severamente o potencial que as leveduras possuem de produzir etanol. De forma a elucidar os efeitos que os diferentes inibidores lignocelulósicos possuem no perfil transcriptômico de Saccharomcyes cerevisiae, nosso grupo irá utilizar sequenciamento de RNA em larga-escala (RNA-seq) para analisar padr?es de alterações transcriptomicas em duas linhages de leveduras, CEN.PK e SA1, quando expostas a diferentes tipos de inibidores. Estes resultados ser?o submetidos a abordagens de biologia de sistemas para identificar que vias metabólicas estão sendo mais afetadas em cada condição inibitória. Ademais, nosso grupo também irá realizar uma varredura genômica em organismos fermentadores de oligossacaridios para identificar genes candidatos para gerar uma linhagem de S. cerevisiae capaz de transportar e metabolizar xylobiose. Para esse passo, iremos combinar engenharia evolutiva com biologia integrativa para identificar quais genes possuem mais chances de produzir efeitos positivos no metabolismo de xylobiose. O presente projeto faz parte do Pacote de Trabalho 3 do projeto colaborativo FAPESP/BBRSC 2015/50612-8 (Uma abordagem integrada para explorar novos paradigmas da produção de biocombustiveis a partir de matéria-prima lingocelulósica).
  Linha de pesquisa Caracterização sistêmica e integrativa da transcriptômica de Saccharomyces cerevisiae para produção de bioprodutos